A história da fisioterapia veterinária no Brasil começa no início dos anos 2000, com profissionais que aprendiam adaptando conhecimentos da fisioterapia humana e buscando referências internacionais, muitas vezes por conta própria. Nomes como Cláudio Ronaldo Pedro, Mônica Martins, Stella Sakata, Solange Mikail, Mônica Veras e Mônica Sartori estiveram entre os pioneiros que abriram caminho quando a especialidade ainda não tinha reconhecimento formal nem estrutura acadêmica.

Em 2002, foi realizado o primeiro curso de fisioterapia e ortopedia veterinária pela Sociedade Paulista de Medicina Veterinária e a primeira pós-graduação na área. Nos anos seguintes, vieram os primeiros simpósios internacionais e a mobilização que garantiu, junto ao sistema CFMV, que a fisioterapia animal fosse conduzida por médicos-veterinários. Em 2008, a ANFIVET foi oficialmente registrada em São Paulo, consolidando anos de luta coletiva em uma associação nacional com atuação permanente.